لٹریچر شیئرنگ: مغربی افریقہ میں جنگلی چھوٹے ستنداریوں کی ویروم پروفائلنگ ناول وائرس اور زونوٹک خطرات کو ظاہر کرتی ہے۔

میں شائع ہونے والی ایک حالیہ تحقیقمائکرو بایومسیرا لیون، مغربی افریقہ میں اکٹھے کیے گئے 846 جنگلی چھوٹے ستنداریوں پر وائرل میٹاجینومک تجزیہ کیا گیا — جن میں چمگادڑ، چوہا اور شریو شامل ہیں۔ مطالعہ نے کل 39 ممالیہ سے وابستہ آر این اے وائرس کی نشاندہی کی، جن میں 26 ناول اور 13 پہلے سے معلوم وائرس شامل تھے۔ ان میں سے، Paramyxoviridae خاندان نے سب سے زیادہ تنوع کا مظاہرہ کیا، جبکہ چوہوں نے وائرل پرجاتیوں کی سب سے بڑی تعداد (n = 26) کو پناہ دی۔

زونوٹک خطرے کی تشخیص سے تین معروف زونوٹک وائرسز کا انکشاف ہوا — انسیفالومیوکارڈائٹس وائرس، لاسا وائرس، اور روکاہیپی وائرس sp. — نیز تین وائرس جن میں ممکنہ پھیلاؤ کا خطرہ ہے: میلین وائرس، چوہا ہیپاٹائٹس وائرس، اور ہنی وائرس A۔ خاص طور پر، نئے شناخت شدہ وائرسوں میں سے، Bat ledanteticvirus 2 کا انسانی جسم سے قریبی تعلق ظاہر ہوتا ہے۔ وائرس۔ سیرولوجیکل تجزیے میں 2.8 فیصد مقامی باشندوں میں اس وائرس کے خلاف اینٹی باڈیز کو بے اثر کرنے کا مزید پتہ چلا، جو تجویز کرتا ہے کہ اس سے پہلے، ممکنہ طور پر ناقابل شناخت، انسانی نمائش کا۔

یہ نتائج مغربی افریقہ میں کافی چوہا کے زیر اثر وائرل ذخائر کی موجودگی کو اجاگر کرتے ہیں اور انسانی – جانوروں کے انٹرفیس میں مربوط نگرانی کی حکمت عملیوں کی اہم اہمیت کو اجاگر کرتے ہیں۔ سیرولوجیکل توثیق کے ساتھ میٹاجینومک اسکریننگ کا امتزاج زونوٹک اور اسپل اوور صلاحیت والے وائرسوں کی شناخت کے لیے ایک مضبوط فریم ورک فراہم کرتا ہے۔

پچھلی دہائی کے دوران، انسانوں میں ابھرتی ہوئی متعدی بیماریوں میں سے 60 فیصد سے زیادہ جانوروں کے ذخائر سے شروع ہوئی ہیں، جن میں چمگادڑ، چوہا اور شریو زونوٹک وائرس کے کلیدی میزبان کے طور پر پہچانے جاتے ہیں۔ افریقہ کو بڑے پیمانے پر زونوٹک بیماریوں کے لیے ایک ہاٹ سپاٹ سمجھا جاتا ہے۔ مثال کے طور پر، سیرا لیون میں 2014-2016 کے دوران ایبولا کے 28,000 سے زیادہ کیسز رپورٹ ہوئے۔

اس خطے میں زونوٹک بیماریوں کے نمایاں بوجھ کے باوجود، جنگلی چھوٹے ممالیہ جانوروں میں وائرس کا تنوع اور تقسیم ناکافی طور پر نمایاں ہے۔ اس خلا کو پورا کرنے کے لیے، محققین نے 2018 اور 2023 کے درمیان سیرا لیون میں تین مقامات پر پکڑے گئے 846 جنگلی چھوٹے ممالیہ جانوروں کا ایک منظم وائروم تجزیہ کیا۔

بنیادی طریقے

مطالعہ نے ایک جامع وائرل میٹاجینومکس ورک فلو کا اطلاق کیا:

• نمونہ پروسیسنگ:دل، جگر، تللی، پھیپھڑوں، اور گردے کے ٹشوز کو جمع کیا گیا، جمع کیا گیا، ہم آہنگ کیا گیا، اور کل RNA نکالنے کا نشانہ بنایا گیا۔
• ترتیب اور اسمبلی:رائبوسومل آر این اے کی کمی لائبریری کی تعمیر سے پہلے کی گئی تھی، اس کے بعد ایلومینا نووا سیق 6000 پلیٹ فارم کا استعمال کرتے ہوئے ہائی تھرو پٹ سیکوینسنگ کی گئی تھی۔ وائرل کانٹیگس کو ڈی نوو جمع کیا گیا تھا۔
• وائرس کی شناخت:وائرس کی شناخت RNA پر منحصر RNA پولیمریز (RdRp) جین کی سیدھ کی بنیاد پر کی گئی تھی۔ بیکٹیریل، فنگل اور پودوں کے وائرسوں کو چھوڑ کر صرف کشیرکا سے وابستہ وائرس کو برقرار رکھا گیا تھا۔
• بایو انفارمیٹکس تجزیہ:Phylogenetic reconstruction، recombination analysis، cross-species transmission network modeling، اور zoonotic خطرے کی تشخیص کی گئی۔
• سیرولوجیکل توثیق:Bat ledantevirus 2 کے لیے VSV پر مبنی سیوڈو وائرس نیوٹرلائزیشن پرکھ تیار کی گئی۔ انسانی سیرا کے 2.8% میں غیر جانبدار اینٹی باڈیز کا پتہ چلا، جو ممکنہ زونوٹک ٹرانسمیشن کا ثبوت فراہم کرتا ہے۔
  

  مطالعہنتائج

  1. وائرل دریافت اور تنوع

  اس مطالعہ نے سیرا لیون میں جمع کیے گئے 846 جنگلی جانوروں پر ٹرانسکرپٹومک سیکوینسنگ کا تجزیہ کیا، جن میں چوہا، چمگادڑ اور شریو شامل ہیں۔ مکمل آر این اے پر منحصر آر این اے پولیمریز (آر ڈی آر پی) جین کی ترتیب کی بنیاد پر، کل 39 ممالیہ سے وابستہ آر این اے وائرسز کی نشاندہی کی گئی، جن میں 13 پہلے سے معلوم وائرس اور 26 نئے وائرس شامل تھے۔

  وائرل کمپوزیشن کے لحاظ سے، Paramyxoviridae خاندان نے تینوں میزبان آرڈرز میں تنوع کی اعلیٰ ترین سطح کی نمائش کی، اس کے بعد Astroviridae اور Picornaviridae۔ میزبان کی تقسیم کے حوالے سے، چوہوں نے وائرل تنوع کا سب سے بڑا حصہ ڈالا، جس میں وائرس کی کل 26 انواع موجود ہیں، جو خطے میں وائرل تنوع کے ذخائر کے طور پر ان کے نمایاں کردار کی نشاندہی کرتے ہیں۔

  2. زونوٹک خطرہ

  زونوٹک رسک اسسمنٹ نے تین مشہور زونوٹک وائرسوں کی نشاندہی کی: انسیفالومیوکارڈائٹس وائرس، لاسا وائرس، اور روکاہیپی وائرس کی اقسام۔ اس کے علاوہ، تین وائرس — میلین وائرس، چوہا ہیپاٹائٹس وائرس، اور ہنی وائرس اے — کی شناخت ممکنہ طور پر پھیلنے کے خطرے کے طور پر کی گئی۔

  26 نئے دریافت ہونے والے وائرسوں میں سے، چار میں فائیلوجنیٹک اور جینومک خصوصیات کی بنیاد پر اعلی زونوٹک صلاحیت رکھنے کی پیش گوئی کی گئی تھی۔ قابل ذکر بات یہ ہے کہ بیٹ لیڈانٹی وائرس 2 نے معروف انسانوں کو متاثر کرنے والے لی ڈینٹیک وائرس سے قریبی فائیلوجنیٹک تعلق ظاہر کیا۔

  بعد میں ہونے والی سیرولوجیکل تحقیقات نے اس تلاش کی مزید تائید کی، کیونکہ مقامی باشندوں سے بیٹ لیڈینٹیوائرس 2 کے خلاف غیر جانبدار اینٹی باڈیز کا پتہ 2.8 فیصد سیرا میں پایا گیا تھا۔ اس نتیجہ سے پتہ چلتا ہے کہ غیر تسلیم شدہ یا غیر علامتی انفیکشن انسانی آبادی کے اندر پہلے سے ہی واقع ہو چکے ہیں، ایک ممکنہ لیکن پہلے غیر شناخت شدہ زونوٹک ٹرانسمیشن پاتھ وے کو اجاگر کرتے ہیں۔

  3. کراس اسپیسز ٹرانسمیشن ڈائنامکس

  کراس پرجاتیوں کے ٹرانسمیشن کے تجزیے نے یہ ظاہر کیا کہ چوہا وائرل شیئرنگ نیٹ ورک کے اندر مرکزی حیثیت پر قبضہ کرتے ہیں، کلیدی نوڈس کے طور پر کام کرتے ہیں جو میزبان پرجاتیوں کے درمیان وائرل ایکسچینج کی سہولت فراہم کرتے ہیں۔ مجموعی طور پر 15 وائرسوں کی شناخت کراس اسپیسز ٹرانسمیشن کی صلاحیت کے طور پر کی گئی۔

  کراس آرڈر ٹرانسمیشن پیٹرن کے مزید تجزیے سے پتہ چلتا ہے کہ وائرل شیئرنگ میزبانوں کے درمیان ایک ہی درجہ بندی کے اندر زیادہ کثرت سے واقع ہوئی ہے، یہ تجویز کرتا ہے کہ میزبان کی نسبت ٹرانسمیشن کی حرکیات میں ایک اہم کردار ادا کرتی ہے۔ اس کے برعکس، چمگادڑوں نے کراس آرڈر ٹرانسمیشن کے لیے نسبتاً کم صلاحیت کا مظاہرہ کیا۔

  اہم بات یہ ہے کہ بعض وائرسوں میں میزبان کی حد میں توسیع کا ثبوت دیکھا گیا۔ مثال کے طور پر، میلین وائرس، جسے پہلے شریو کے لیے مخصوص سمجھا جاتا تھا، اس تحقیق میں چوہوں میں بھی پایا گیا، جو میزبان کی موافقت میں ممکنہ تبدیلی اور وسیع تر منتقلی کے بڑھتے ہوئے خطرے کی نشاندہی کرتا ہے۔

  

  نتائج اور صحت عامہ کے مضمرات

  • جنگلی چھوٹے ستنداریوں میں اعلی وائروم تنوع:39 آر این اے وائرسز کی دریافت، جن میں 26 نویل پرجاتی شامل ہیں، خطے میں وائرس کے ایک بڑے ذخائر کو ظاہر کرتی ہے اور پہلی بار اعلی زونوٹک صلاحیت کے حامل ناول وائرس کی اطلاع دیتی ہے (مثلاً، بیٹ لیڈینٹی وائرس 2)۔
  • چوہا ترجیحی نگرانی کے اہداف کے طور پر:چوہا وائرل ٹرانسمیشن کے کلیدی مرکز کے طور پر کام کرتے ہیں اور سب سے زیادہ وائرل تنوع رکھتے ہیں، جو سب سے زیادہ پھیلنے والے خطرے کی نمائندگی کرتے ہیں۔
  • مربوط نگرانی کی حکمت عملیوں کی ضرورت:نتائج فعال نگرانی کے پروگراموں میں چوہوں کو ترجیح دینے اور انسانی وائلڈ لائف انٹرفیس پر میٹاجینومکس، سیرولوجی، اور ماحولیاتی نگرانی کو یکجا کرنے والے مربوط طریقوں کو نافذ کرنے کی حمایت کرتے ہیں۔

  مجموعی طور پر، یہ مطالعہ ابھرتی ہوئی زونوٹک بیماریوں کے لیے ابتدائی انتباہی نظام اور خطرے کی تشخیص کے فریم ورک کی حمایت کرنے کے لیے اہم ثبوت فراہم کرتا ہے، جس سے زیادہ خطرے والے علاقوں میں فعال نگرانی کی اہمیت کو تقویت ملتی ہے۔

  پروڈکٹ کی معلومات