ہیلونگ جیانگ میں چوہا "پیتھوجین بینک" کی نقاب کشائی: لاسا اور ہنٹا وائرس سمیت کلیدی پیتھوجینز کی کھوج

ایک حالیہ میٹجینومک مطالعہ نے ہیلونگ جیانگ صوبے میں چوہاوں کے ذریعے لے جانے والے وائرسوں اور بیکٹیریا کے ایک نمایاں طور پر متنوع سپیکٹرم کا انکشاف کیا ہے، جس میں لاسا وائرس، امور وائرس، سالمونیلا اور یرسینیا پیسٹس شامل ہیں۔

تحقیق نے استعمال کیا۔میکرو اور مائیکرو ٹیسٹ سے پیتھوجین آر این اے افزودگی کٹ، تحقیقات کیپچر ٹیکنالوجی پر مبنی۔ میزبان rRNA اور دیگر محفوظ میزبان ٹکڑوں کو منتخب طور پر ختم کرنے سے، طریقہ کار نے مؤثر طریقے سے مائکروبیل RNA کو برقرار رکھا، جس سے روگزن کی شناخت کی حساسیت میں نمایاں بہتری آئی۔ یہ پیتھوجین آر این اے کی افزودگی کا مرحلہ اعلیٰ پتہ لگانے کی شرح کو حاصل کرنے میں اہم تھا اور اس نے پیتھوجین کی نگرانی کے لیے مضبوط تکنیکی مدد فراہم کی۔

چوہا: زونوٹک بیماریوں کے کلیدی ذخائر

چوہا ممالیہ جانوروں کا سب سے زیادہ پرجاتیوں سے مالا مال اور وسیع پیمانے پر تقسیم کیا جانے والا گروپ ہے، جو دنیا بھر میں 2,000 سے زیادہ پرجاتیوں پر مشتمل ہے اور تمام ممالیہ جانوروں کی 40% سے زیادہ پر مشتمل ہے۔

اپنی ماحولیاتی اہمیت سے ہٹ کر، چوہا بڑے ذخائر اور متعدد زونوٹک پیتھوجینز کے ویکٹر کے طور پر کام کرتے ہیں۔کیونکہ چوہا کی رہائش گاہیں انسانی ماحول کے ساتھ کثرت سے اوورلیپ ہوتی ہیں — براہ راست کاٹنے کے ذریعے، اخراج کے ساتھ رابطے کے ذریعے، یا پسو اور ذرات کے ذریعے بالواسطہ منتقلی — جن پیتھوجینز کو وہ پناہ دیتے ہیں وہ صحت عامہ کے مستقل خطرات کا باعث بنتے ہیں۔

قابل ذکر بات یہ ہے کہ ابھرتی ہوئی متعدی بیماریوں میں سے 70% سے زیادہ جنگلی حیات سے شروع ہوتی ہیں، جن میں چوہا سب سے اہم وائرل ذخائر میں سے ایک کی نمائندگی کرتے ہیں۔

ہیلونگ جیانگ بارڈر ریجن: پیتھوجین سرویلنس کے لیے ایک فرنٹ لائن

ہیلونگ جیانگ، شمال مشرقی چین کا ایک سرحدی صوبہ ہے، جس کے پاس وافر ماحولیاتی وسائل ہیں اور متعدد ممالک کے ساتھ اس کی سرحدیں ملتی ہیں۔ بھرپور حیاتیاتی تنوع اور بار بار سرحد پار آبادی کی نقل و حرکت کا امتزاج روگزنق کی منتقلی کے لیے سازگار حالات پیدا کرتا ہے۔

جون اور جولائی 2021 کے درمیان، محققین نے موڈان جیانگ شہر کے ہینگڈاؤہیزی ٹاؤن سے 67 جنگلی چوہوں کو اکٹھا کیا۔ نمونوں میں شامل ہیں:

ایل 20اپوڈیمس جزیرہ نما

ایل 47مائیوڈس روفوکانس

تمام نمونے رہائشی علاقوں اور آس پاس کے کھیتوں میں پکڑے گئے تھے، جو انسانی بستیوں اور جنگلی حیات کی رہائش گاہوں کے درمیان قریبی رابطہ کو اجاگر کرتے ہیں۔

پیتھوجین افزودگی ٹیکنالوجی: میزبان پس منظر کی مداخلت پر قابو پانا

میٹیجینومک ترتیب میں، میزبان آر این اے عام طور پر سیکوینسنگ ریڈز پر حاوی ہوتا ہے، کم کثرت پیتھوجین سگنلز کو ماسک کرتا ہے۔

اس چیلنج سے نمٹنے کے لیے، مطالعہ نے کام کیا۔میکرو اور مائیکرو ٹیسٹ کی پیتھوجن میٹاجینومک ڈیٹیکشن کٹ۔ پروب کیپچر ٹکنالوجی کا استعمال کرتے ہوئے، خاص طور پر ڈیزائن کردہ پروبس rRNA اور محفوظ ترتیبوں کی میزبانی سے منسلک ہوتے ہیں، ان کی کمی کو قابل بناتے ہیں اور اس طرح مائکروبیل RNA کو تقویت دیتے ہیں۔

اس نقطہ نظر نے پیتھوجین کا پتہ لگانے کی حساسیت میں کافی حد تک بہتری لائی ہے، جس سے نیچے کی دھارے کی ترتیب کو پیتھوجین ریڈز کے زیادہ تناسب کو بحال کرنے کی اجازت ملتی ہے۔ افزودگی کے قدم نے چوہوں کے ذریعے لے جانے والے پیتھوجین سپیکٹرم کی درستگی کے لیے ایک ٹھوس بنیاد رکھی۔

افزودگی کے بعد، آر این اے کے نمونے ریورس ٹرانسکرپشن، لائبریری کی تعمیر، اور ہائی تھرو پٹ ترتیب سے گزرے۔ بایو انفارمیٹک تجزیہ میں شامل ہیں:

l میزبان جینوم فلٹرنگ

l کریکن 2 کا استعمال کرتے ہوئے ٹیکسونومک درجہ بندی

l بریکن کے ساتھ کثرت کی اصلاح

اس ورک فلو نے وائرل اور بیکٹیریل کمیونٹیز کا ایک جامع پروفائل تیار کیا۔

تحقیقی نتائج: ایک سے زیادہ وائرس اور بیکٹیریا کی مشترکہ گردش

وائرل نتائج

پائے جانے والے وائرس کا تعلق 21 وائرل فیملیز سے ہے، بشمولArenaviridaeاورHantaviridae.

کے ذریعےڈی نوومیگاہٹ کا استعمال کرتے ہوئے اسمبلی، 154 وائرل کنٹیگس پیدا ہوئے، جن میں سے 110 آٹھ خاندانوں کے 19 وائرس کے ساتھ منسلک ہوئے۔

In اپوڈیمس جزیرہ نمامندرجہ ذیل وائرس کی نشاندہی کی گئی تھی:

l ارینا وائرس: لاسا وائرس، وینزو وائرس، گیرو وائرس

l ہنٹا وائرس: امور وائرس، پومالا وائرس

In مائیوڈس روفوکانس، چوہا آرٹیروائرس اور امور وائرس کا پتہ چلا۔

ان پیتھوجینز میں سے:

l لاسا وائرس وائرل ہیمرجک بخار کا ایک عامل ہے، جس میں اموات کی شرح تقریباً 20% تک پہنچ جاتی ہے۔

l امور وائرس رینل سنڈروم (HFRS) کے ساتھ ہیمرج بخار کے لئے ذمہ دار پیتھوجینز میں سے ایک ہے۔ چین ہنٹا وائرس کے انفیکشن کے سب سے زیادہ عالمی بوجھ کی اطلاع دیتا ہے۔

بیکٹیریل نتائج

مجموعی طور پر 1،051 بیکٹیریل جنرا کی تشریح کی گئی۔

سب سے زیادہ پرچر نسل یہ تھے:

lسالمونیلا(26–31%)

lیرسینیا(11–23%)

سالمونیلاخوراک سے پیدا ہونے والا ایک بڑا پیتھوجین ہے، جو دنیا بھر میں ٹائیفائیڈ بخار کے اندازے کے مطابق 9 ملین کیسز اور سالانہ تقریباً 110,000 اموات کا ذمہ دار ہے۔

Yersinia pestisطاعون کا سبب بننے والا ایجنٹ تین تاریخی وبائی امراض کا ذمہ دار رہا ہے۔ ہیلونگ جیانگ صوبہ چین کے قدرتی طاعون کے مرکز کے طور پر پہچانا جاتا ہے اور طاعون کی نگرانی کے لیے ایک ترجیحی علاقہ ہے۔

مطالعہ کی اہمیت

سائنسی شراکتیں۔

یہ مطالعہ ہیلونگ جیانگ کے چوہوں میں لاسا وائرس کے ٹکڑوں اور چوہے کی شریانوں کے وائرس کی پہلی رپورٹ کی نمائندگی کرتا ہے، جس سے چین کے چوہا سے پیدا ہونے والے پیتھوجین ڈیٹا بیس کو وسعت ملتی ہے۔

یہ منظم طریقے سے مقامی چوہا آبادی میں وائرل اور بیکٹیریل کمیونٹیز کو نمایاں کرتا ہے، جو سرحدی علاقوں میں زونوٹک بیماری کی نگرانی کے لیے بنیادی ڈیٹا فراہم کرتا ہے۔

صحت عامہ کے مضمرات

نتائج مسلسل نگرانی اور پیتھوجین اسکریننگ کی ضرورت کو اجاگر کرتے ہیں۔A. جزیرہ نمااورM. rufocanus.

اعداد و شمار رینل سنڈروم کے ساتھ طاعون اور ہیمرج بخار جیسی بیماریوں کے لیے ماخذ کنٹرول کی حکمت عملیوں کی حمایت کرنے والے سائنسی ثبوت فراہم کرتے ہیں۔

طریقہ کار کی طاقتیں

میٹجینومک سیکوینسنگ معروف اور ناول دونوں پیتھوجینز کی غیرجانبداری سے پتہ لگانے کے قابل بناتی ہے۔

اس مطالعہ میں، میکرو اور مائیکرو ٹیسٹ کی پیتھوجین افزودگی ٹیکنالوجی نے مضبوط کارکردگی کا مظاہرہ کیا، جس سے پیچیدہ حیاتیاتی نمونوں میں ٹارگٹ پیتھوجین کا پتہ لگانے میں مؤثر طریقے سے اضافہ ہوا۔ نتائج وائلڈ لائف کی نگرانی میں اعلی حساسیت کے پیتھوجین کی شناخت کی حمایت کرنے کی اس کی صلاحیت کی تصدیق کرتے ہیں۔

پروڈکٹ کی سفارش

اس مطالعہ میں اس کے کامیاب اطلاق کی بنیاد پر، میکرو اور مائیکرو ٹیسٹ پیتھوجین آر این اے اینرچمنٹ کٹ کو میٹیجینومک سرویلنس ریسرچ کے لیے انتہائی سفارش کی جاتی ہے۔

میزبان نیوکلک ایسڈز کو مؤثر طریقے سے ختم کرکے اور مائکروبیل ترتیب کو افزودہ کرکے، کٹ پتہ لگانے کی حساسیت اور ڈیٹا کے معیار کو نمایاں طور پر بہتر بناتی ہے۔ یہ پیچیدہ نمونوں میں پیتھوجین کی درست دریافت کے لیے ایک ضروری ٹول کی نمائندگی کرتا ہے اور صحت عامہ کی نگرانی، زونوٹک خطرے کی تشخیص، اور وباء کی تیاری کے لیے مضبوط تکنیکی مدد فراہم کرتا ہے۔

Contact to learn more: marketing@mmtest.com