لوزہو، چین کے ایک پرائمری اسکول میں گروپ سی روٹا وائرس کا پھیلنا، اور میکرو اور مائیکرو ٹیسٹ کی مکمل جینوم سیکوینسنگ ٹیکنالوجی درست ماخذ کا پتہ لگانے کے قابل بناتی ہے۔

حال ہی میں،چائنا سی ڈی سی ہفتہ وارنے اکتوبر 2025 میں صوبہ سیچوان کے لوزہو کے ایک پرائمری اسکول میں گروپ سی روٹا وائرس (RVC) کی وجہ سے ہونے والے شدید گیسٹرو اینٹرائٹس کے پھیلنے کی وبائی امراض اور ایٹولوجیکل تحقیقات کو بیان کرتے ہوئے ایک اہم تحقیقی مضمون شائع کیا۔ ترتیب دینے والی ٹیکنالوجی نے تحقیقات میں اہم کردار ادا کیا۔ پیتھوجین کی درست شناخت اور جامع جینومک خصوصیات کو فعال کرنے کے ذریعے، ٹیکنالوجی نے تیزی سے پھیلنے کی تصدیق، درست ماخذ کا پتہ لگانے، اور مؤثر وبائی کنٹرول کے لیے اہم سائنسی ثبوت فراہم کیے ہیں۔

اچانک پھیلنا: جنوب مغربی چین میں پہلی بار RVC پھیلنے کی اطلاع ملی

15 اکتوبر 2025 کو، لوزہو کے ایک پرائمری اسکول میں گیسٹرو اینٹرائٹس کی شدید وباء پھیلی۔ اسکول کی کل آبادی 1,943 طلباء اور عملے کی تھی، جس میں 32 کیس رپورٹ ہوئے، جن میں 6 لیبارٹری سے تصدیق شدہ اور 26 طبی طور پر تشخیص شدہ کیسز شامل ہیں، جس کے نتیجے میں حملے کی مجموعی شرح 1.65% ہے۔ 15 اور 16 اکتوبر کے درمیان یہ وبا عروج پر تھی، کلاس 7، گریڈ 5 میں حملے کی سب سے زیادہ شرح (23.08%) تھی۔ زیادہ تر مریض اسکول جانے والے بچے تھے (درمیانی عمر: 10 سال)، بنیادی طور پر الٹی (65.62%)، اسہال (46.87%)، اور پیٹ میں درد (37.50%) تھے۔ علامات عام طور پر 1-3 دن تک جاری رہتی ہیں، اور تمام مریض بغیر کسی شدید پیچیدگی کے ٹھیک ہو جاتے ہیں۔

وبائی امراض کی تحقیقات نے انڈیکس کیس کی شناخت کلاس 7، گریڈ 5 میں ایک 11 سالہ لڑکے کے طور پر کی۔ اس کی چھوٹی بہن نے اس سے پہلے بھی ایسی ہی علامات پیدا کی تھیں، جو ابتدائی ذریعہ کے طور پر گھریلو منتقلی کی تجویز کرتی تھیں۔ الٹی کا کیمپس میں ناکافی انتظام — جس میں بروقت جراثیم کشی یا علاقے کو الگ تھلگ کیے بغیر براہ راست جھاڑو اور ٹھکانے لگانا — طلباء میں ہاتھوں کی ناقص حفظان صحت کے ساتھ مل کر، ممکنہ طور پر مزید منتقلی میں سہولت فراہم کرتا ہے۔ سب سے زیادہ متاثرہ کلاس رومز دوسری اور پانچویں منزل کے درمیان واقع تھے اور ملحقہ مردانہ بیت الخلاء کے درمیان واقع تھے، جس سے ظاہر ہوتا ہے کہ ایروسول اور رابطہ ٹرانسمیشن دونوں نے پھیلنے میں حصہ ڈالا ہے۔

تحقیقات خاص طور پر چیلنجنگ بن گئی کیونکہ روٹین کی روٹین کی اسکریننگ، بشمول نورووائرس اور گروپ اے روٹا وائرس کے ٹیسٹ، کے منفی نتائج برآمد ہوئے، جس سے ظاہر ہوتا ہے کہ ایک غیر معمولی پیتھوجین ذمہ دار ہے۔

ایٹولوجیکل تشخیص: میکرو اور مائیکرو ٹیسٹ کی مکمل جینوم کی ترتیب مجرم کی شناخت کرتی ہے

نورووائرس کی ابتدائی جانچ منفی تھی۔ Luzhou CDC نے بعد میں ایک ملٹی پلیکس معدے کے پیتھوجین ریئل ٹائم پی سی آر پرکھ کا استعمال کیا جو بیک وقت 28 پیتھوجینز کا پتہ لگانے کے قابل تھا، جن میں 8 وائرس، 17 بیکٹیریا، اور 3 پرجیوی شامل ہیں، آٹھ طبی نمونوں کی اسکریننگ کے لیے۔ 17 اکتوبر کو، گروپ سی روٹا وائرس کے لیے چھ نمونوں کا ٹیسٹ مثبت آیا، جس نے کامیابی کے ساتھ کارآمد پیتھوجین کی شناخت کی۔

پھیلنے کے ماخذ کا مزید پتہ لگانے کے لیے، تفتیش کاروں نے پانچ مثبت نمونوں پر نینو پور میٹاجینومک سیکوینسنگ اور میکرو اینڈ مائیکرو ٹیسٹ کی پروب-کیپچر پوری جینوم کی افزودگی کی ترتیب دونوں کو انجام دیا۔ اس نقطہ نظر نے کامیابی کے ساتھ پانچ مکمل RVC جینوم ترتیب (SC01–SC05) تیار کیے۔ تیز رفتار ملٹی پلیکس پی سی آر اسکریننگ کی مربوط حکمت عملی جس کے بعد ہائی ریزولوشن مکمل جینوم کی ترتیب نے درست مالیکیولر ایپیڈیمولوجی اور سورس ٹریسنگ کے لیے مضبوط تکنیکی مدد فراہم کی۔

سائنسی بصیرت: جنوب مغربی چین میں M2 جین ٹائپ کی پہلی شناخت

میکرو اور مائیکرو ٹیسٹ کی ٹکنالوجی کا استعمال کرتے ہوئے تیار کردہ اعلی معیار کے پورے جینوم ڈیٹا کی بنیاد پر، تحقیقی ٹیم نے کئی اہم سائنسی نتائج کی اطلاع دی:

مونوکلونل پھیلنے کی تصدیق:تمام پانچ وائرل آئسولیٹس نے ایک جیسی مکمل جینوم جین ٹائپ (G4-P[2]-I2-R2-C2-M2-A2-N2-T2-E2-H2) کا اشتراک کیا، جس میں صرف 0-1 سنگل نیوکلیوٹائڈ پولیمورفزم (SNP) فرق ہے، جس سے حتمی طور پر یہ ظاہر ہوتا ہے کہ پھیلنے کی ابتدا ایک زنجیر سے ہوئی ہے۔

M2 جین ٹائپ کی دریافت:فائیلوجنیٹک تجزیے سے یہ بات سامنے آئی ہے کہ Luzhou RVC strains کا تعلق M2 genotype کے بجائے M3 genotype سے تھا جسے پہلے چینی RVC سٹرینوں میں غالب سمجھا جاتا تھا۔ یہ تلاش چین میں RVC جین ٹائپ کی تقسیم کی روایتی سمجھ کو چیلنج کرتی ہے اور جنوب مغربی چین میں M2 جین ٹائپ کے ابھرنے کی تصدیق کرتی ہے۔

بین الاقوامی ٹرانسمیشن لنکس کا ثبوت:مکمل جینوم کے موازنہ نے Luzhou strains اور RVC strains کے درمیان اعلیٰ جینیاتی مماثلت کا مظاہرہ کیا جو پہلے Yunnan (2025), Novosibirsk, Russia (2017) اور Italy (2012) میں رپورٹ کیے گئے تھے، جو کہ ایک فعال یوریشین ٹرانسمیشن نیٹ ورک کے وجود کی تجویز کرتے ہیں۔

روک تھام اور کنٹرول کے مضمرات: جلد پتہ لگانا اور تیز مداخلت ضروری ہے۔

پیتھوجین کی شناخت کے بعد، Luzhou CDC نے فوری طور پر کنٹرول کے جامع اقدامات نافذ کیے، جن میں کیس آئسولیشن، ماحولیاتی جراثیم کشی، معیاری الٹی مینجمنٹ، اور عارضی کلاس معطلی شامل ہیں۔ یہ وباء کامیابی کے ساتھ ایک ہی انکیوبیشن مدت کے اندر موجود تھی، 21 اکتوبر کے بعد کوئی اضافی کیس رپورٹ نہیں ہوا۔

یہ تفتیش صحت عامہ کا ایک اہم سبق بھی فراہم کرتی ہے: کلسٹرڈ گیسٹرو اینٹرائٹس کے پھیلنے کے لیے جو گروپ اے روٹا وائرس اور نورو وائرس دونوں کے لیے منفی ٹیسٹ کرتے ہیں، گروپ سی روٹا وائرس اور دیگر غیر گروپ اے روٹا وائرس کو معمول کی تشخیصی اسکریننگ میں شامل کیا جانا چاہیے۔

یہ مطالعہ جنوب مغربی چین میں گروپ C روٹا وائرس کے پھیلنے کی پہلی اطلاع اور خطے میں M2 جین ٹائپ کی پہلی شناخت کی نمائندگی کرتا ہے، جو مشرقی ایشیا میں RVC وبائی امراض کی موجودہ تفہیم کو بڑھا رہا ہے۔ اس تحقیقات میں، میکرو اور مائیکرو ٹیسٹ کے مربوط حل نے ملٹی پلیکس پی سی آر اسکریننگ کو مکمل جینوم افزودگی کی ترتیب کے ساتھ جوڑ کر تیزی سے پیتھوجین کی شناخت اور ہائی ریزولوشن مالیکیولر سورس ٹریسنگ کو قابل بنا کر اہم عملی قدر کا مظاہرہ کیا، جو کہ مستقبل میں بیماری کی درست تفتیش اور کنٹرول کے لیے ایک قابل تولید تکنیکی فریم ورک فراہم کرتا ہے۔